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蛋白质组(Proteome),指由一个基因组或一个细胞、组织所表达的全部蛋白质。蛋白质组是在组织、细胞的整体蛋白质水平上,探索蛋白质作用模式、功能机理、调节控制以及蛋白与蛋白相互作用,从而获得对疾病过程、细胞生理病理过程及调控网络的全面而深入的认识,以揭示生命活动的基本规律。同时也为临床诊断、药物筛选、新药开发和医疗等诸多应用领域提供理论依据。
蛋白质组学可应用于蛋白功能、标志物、疾病机理、药物靶点,农作物发育、食品安全与营养,新型病毒抑制因子的挖掘等研究领域。蛋白组学对深入了解生命现象的本质、疾病发生机理、疾病诊断乃至药物开发都具有重大的意义。
实验流程
样品准备——蛋白提取——胰酶降解——HPLC分级——抗体富集——质谱分析——数据处理——生物信息学分析。
蛋白组学服务项目
序号 | 项目 | 服务内容 |
蛋白质组定量 | ||
1 | 非靶向蛋白组定量 | iTRAQ |
2 | TMT | |
3 | SILAC(不包含细胞培养) | |
4 | Label free 非标记蛋白组分析 | |
5 | 4D-Label free 非标记蛋白组分析 | |
6 | DIA 蛋白组分析 | |
7 | 4D-DIA蛋白组分析 | |
8 | 靶向蛋白组定量 | PRM |
蛋白质鉴定 | ||
9 | 蛋白质分子量 | EIC-MS/MALDI-MS |
10 | SDS-PAGE | |
11 | SEC-MALS | |
12 | 多肽测序 | LC-MS |
13 | Edman | |
14 | 蛋白质鉴定 | 蛋白质鉴定 |
15 | 蛋白质修饰鉴定(不富集) | |
16 | 4D Labelfree 磷酸化修饰 | |
17 | 4D Labelfree 乙酰化/泛素化修饰 | |
18 | DIA磷酸化修饰 | |
19 | 4D-DIA 磷酸化修饰 | |
20 | N端测序 | |
21 | C端测序 | |
22 | denovo测序 | |
23 | 蛋白免疫印迹WB | |
24 | 免疫组化IHC | |
25 | 免疫荧光IF | |
蛋白质互作 | ||
26 | CoIP蛋白质免疫共沉淀 | COIP-WB |
27 | COIP-MS | |
28 | 蛋白质pull down试验 | Pull-down WB |
29 | Pull-down MS(1个实验组+2个对照组) | |
30 | DNA pull down试验 | DNA pull down WB(不含探针费) |
31 | DNA pull down MS(不含探针费) | |
32 | RNA pull down WB(不含探针费) | |
33 | RNA pull down qPCR | |
34 | RNA pull down MS(不含探针费) | |
35 | ChIP染色质免疫共沉淀 | ChIP-qPCR |
36 | ChIP-seq | |
37 | RIP RNA免疫共沉淀 | RIP-qPCR |
38 | RIP-seq |
代谢组学应用领域
1.农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等
2.畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等
3.基础医学、临床诊断:生物标志物筛选,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等
4.生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等
5.微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等