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蛋白组学

蛋白组学是研究细胞、组织或整个生物体中所有蛋白质的学科,包括蛋白质的表达、修饰、相互作用和功能。它是系统生物学的一个分支,对于理解生命过程和疾病机制具有重要意义。

蛋白质组(Proteome),指由一个基因组或一个细胞、组织所表达的全部蛋白质。蛋白质组是在组织、细胞的整体蛋白质水平上,探索蛋白质作用模式、功能机理、调节控制以及蛋白与蛋白相互作用,从而获得对疾病过程、细胞生理病理过程及调控网络的全面而深入的认识,以揭示生命活动的基本规律。同时也为临床诊断、药物筛选、新药开发和医疗等诸多应用领域提供理论依据。

蛋白质组学可应用于蛋白功能、标志物、疾病机理、药物靶点,农作物发育、食品安全与营养,新型病毒抑制因子的挖掘等研究领域。蛋白组学对深入了解生命现象的本质、疾病发生机理、疾病诊断乃至药物开发都具有重大的意义。

实验流程

样品准备——蛋白提取——胰酶降解——HPLC分级——抗体富集——质谱分析——数据处理——生物信息学分析。

蛋白组学服务项目

序号 项目 服务内容
蛋白质组定量
1 非靶向蛋白组定量 iTRAQ
2 TMT
3 SILAC(不包含细胞培养)
4 Label free 非标记蛋白组分析
5 4D-Label free 非标记蛋白组分析
6 DIA 蛋白组分析
7 4D-DIA蛋白组分析
8 靶向蛋白组定量 PRM
蛋白质鉴定
9 蛋白质分子量 EIC-MS/MALDI-MS
10 SDS-PAGE
11 SEC-MALS
12 多肽测序 LC-MS
13 Edman
14 蛋白质鉴定 蛋白质鉴定
15 蛋白质修饰鉴定(不富集)
16 4D Labelfree  磷酸化修饰
17 4D Labelfree 乙酰化/泛素化修饰
18 DIA磷酸化修饰
19 4D-DIA 磷酸化修饰
20 N端测序
21 C端测序
22 denovo测序
 
23 蛋白免疫印迹WB
24 免疫组化IHC
25 免疫荧光IF
蛋白质互作
26 CoIP蛋白质免疫共沉淀 COIP-WB
27 COIP-MS
28 蛋白质pull down试验 Pull-down WB
29 Pull-down MS(1个实验组+2个对照组)
30 DNA pull down试验 DNA pull down WB(不含探针费)
31 DNA pull down MS(不含探针费)
32 RNA pull down WB(不含探针费)
33 RNA pull down qPCR
34 RNA pull down MS(不含探针费)
35 ChIP染色质免疫共沉淀 ChIP-qPCR
36 ChIP-seq
37 RIP RNA免疫共沉淀 RIP-qPCR
38 RIP-seq

代谢组学应用领域

1.农林领域:抗逆胁迫机制,生长发育机制,育种保护研究等

2.畜牧业:肉类及乳品质研究,致病机理研究等

3.基础医学、临床诊断:生物标志物筛选,疾病机理机制,疾病分型,个性化治疗等

4.生物医药:药物作用机理,药效评价,药物开发等

5.微生物领域:致病机理,耐药机制,病原体-宿主相互作用研究等

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