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16S rDNA 是所有的细菌都具有的基因序列，长度适中(在1500~1600bp)，进化上具有良好的时钟性质，结构与功能上具有高度的保守性，能很好体现不同菌属之间的差异，又能轻松利用测序技术得到其序列，故被细菌学家和分类学家普遍认可，素有“细菌化石”之称。
ITS(Internal Transcribed Spacer)鉴定是指对ITS序列进行DNA测序，通过将测序得到的ITS序列与已知真菌ITS序列比较，从而获得待测真菌种属信息的一种方法。
相比传统生理生化鉴定，分子型鉴定具有可检测范围广、重复性好、一致性高、数字化方便存储和溯源调查、数据库鉴定范围广等特点。
实验流程
获取纯培养物——基因组DNA提取——引物设计与合成——PCR扩增16S rDNA——PCR产物纯化——测序——序列比对分析
样品要求
1) 基因组DNA：浓度≥50ng/μL，体积≥10μL，完整性好。
2) 新鲜平板/斜面：新鲜平板应长有分离的单菌落，斜面/穿刺菌请确保送测样品由单菌落培养而来;请确保您提供的样品经过平板或斜面上的单菌落分离。
16S/ITS菌株鉴定应用
16S rRNA和ITS基因序列鉴定在微生物学研究、临床诊断、环境监测、食品安全评估等领域都有广泛的应用。例如，在临床诊断中，通过鉴定病原体的16S rRNA或ITS基因序列，可以快速准确地诊断感染性疾病。在环境监测中，这些技术可以用来分析土壤、水体等环境样本中的微生物组成，评估生态系统的健康状况。
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